在《辐射4》中，存在多条路线供玩家选择，这些路线包括但不限于以下几种：
学院线（儿子路线）
这是游戏的主要剧情线之一，玩家可以选择跟随儿子走向学院，最终掌握强大的力量。
兄贵线（钢铁也可以掰弯）
玩家可以选择与兄弟会合作，通过一系列任务和战斗，最终影响废土的格局。
铁路线（共产主义好）
民兵线（不难群众一针一线）
玩家可以选择支持民兵组织，通过一系列任务，最终实现和平。
学院和民兵共存线
玩家可以同时完成学院和民兵的任务，实现两者的共存。
四方共存线
通过不完成抉择性主线下杀死学院、钢铁和铁路的boss，触发隐藏任务，最终实现四大势力的和平共存。
民兵钢铁共存线
玩家可以同时进行民兵和钢铁兄弟会的任务，通过选择和平解决或引导到其他势力，最终实现共存。
彩蛋线
最速通关线，新档开局不去避难所直接去桥，可以快速体验游戏。
