精灵宝可梦卡牌的摆放顺序如下：
洗牌
双方先洗牌，然后将套牌放置在场地上的套牌区。
抽牌
从己方套牌里抽7张牌。
如果手牌中有基本神奇宝贝卡或化石卡，则将其面朝下置于出战神奇宝贝区，同时可以将其他的基本神奇宝贝卡或化石卡面朝下置于后备区。
如果没有基本神奇宝贝卡或化石卡，则向对手展示手牌，待对手确认没有后，将它们洗入套牌中，然后再次从己方套牌里抽7张牌，如此往复直到抽到基本神奇宝贝卡或化石卡为止。
回合开始
当一方抽到基本神奇宝贝卡或化石卡而另一方没有时，每将手牌洗入套牌中一次，抽到基本神奇宝贝卡的玩家可以选择从己方套牌中再多抽1张牌（不是必须）。
双方将自己的套牌上方6张牌移动至奖品卡区。
如果双方手中还有基本神奇宝贝卡或化石卡，此时可以继续放置在后备区。
决定回合顺序
通过猜拳或猜硬币正反面决定双方的回合先后顺序，由胜方开始第一回合。
开始游戏
双方将出战神奇宝贝翻开正面，游戏开始。
回合阶段
阶段1：从套牌顶抽1张牌。
